自1991年3月中国海关在广州建立第一个海关实验室以来，十几年中又在天津、上海、大连先后建立了3个海关实验室。它们分别承担着华南及西南地区16个海关、华北及西北地区11个海关、华东地区10个海关、东北地区4个海关的进出境货物和物品的化验鉴定任务。
中国海关实验室装备了一大批先进的检测设备，基本能满足目前海关进出境货物和物品的常规检测要求。中国海关实验室的工作人员是一个学历高、知识新、技术专的年青队伍。平均年龄为35.2岁，其中80%以上的工作人员具有本科及以上学历，20%的工作人员具有高级工程师技术职称。中国海关实验管理规范，按照ISO/IEC 17025（GB/T 15481）的要求建立了质量管理体系并严格执行，目前中国海关的4个实验室已全部通过中国实验室国家认可委员会（CNAL）的认可。
作为海关科技的重要组织部分，中国海关实验室通过其科学、高效和严谨的工作，为海关的商品归类、估价、原产地确定、打击走私等多种业务提供了专业的技术支持和保障，确保中国海关“依法行政、为国把关、服务经济、促进发展”工作方针的贯彻落实。中国海关实验室的工作主要体现在三方面：一是对进出境货物和物品的属性、成分、含量、规格及品质等进行分析鉴定，为各地海关的执法提供科学依据；二是为海关工作人员提供专业培训，提高海关关员的业务素质；三是根据海关工作的特点，研究开发符合海关工作需要的标准分析方法、海关行业标准以及相关检测装备等。