中国科学院高能物理研究所是我国高能物理研究、先进加速器技术研究开发、先进射线技术及射线应用的综合性研究基地。
高能所设有8个研究单位，开展的研究工作主要有高能物理、宇宙线和高能天体物理、理论物理、加速器物理与技术、同步辐射及自由电子激光、核分析技术应用等。大型科研设施和装置主要有北京正负电子对撞机(BEPC)、北京谱仪(BES)、北京同步辐射装置(BSRF)、北京自由电子激光装置(BFEL)、西藏羊八井广延大气簇射阵列和强流慢正电子装置等。
建所50年来，我国的高能物理研究有了飞速发展，特别是改革开放的20多年来，高能所经历了翻天覆地的变化。1988年10月，北京正负电子对撞机的建成和对撞成功，为我国粒子物理研究和同步辐射应用开辟了广阔的前景，也使高能所从此成为世界八大高能物理实验研究中心之一，在τ-粲物理实验研究方面居于国际领先水平。
北京正负电子对撞机和北京谱仪目前是国际上工作在τ-粲能区唯一的高亮度正负电子对撞机和先进探测器，1990年运行以来已得到一批在国际高能物理界有影响的研究成果。例如：τ轻子质量的精确测量、DS粒子衰变常数的首次与模型无关的直接测量、J/Ψ粒子共振参数的精确测量、R值测量等。目前，BES已拥有J/ψ事例6000多万个，相当于国际同能区对撞机获取事例总和的近4倍，有把握取得高水平的物理成果，使BES近几年内在粲偶素和胶球物理领域保持国际领先地位。
北京同步辐射装置是目前国内唯一的广谱辐射源，已提供给全国200多个用户的800多个课题开展交叉学科的研究。在凝聚态物理、材料科学、生物、医学、地矿、石化、环境科学等方面，充分发挥了同步辐射实验方法的优势，取得了一批高水平的实验成果。
粒子天体物理重点实验室是我国此领域的重要研究基地。中日合作建成的西藏羊八井广延大气簇射阵列是国际四大超高能γ天文和超高能宇宙线研究阵列之一。目前，中意合作15000m2的ARGO实验大厅落成，已进入全面安装阶段，它将使羊八井宇宙线观测站在本世纪初仍保持国际领先地位。
核分析开放实验室主要开展中子活化分析、质子激发的X射线分析、离子束分析、X射线荧光分析、穆斯堡尔谱、正电子湮灭等方面的应用基础研究和应用工作。
由高能所研制的北京自由电子激光装置于1993年5月实现受激辐射，同年12月实现饱和振荡，从而使我国在这一高科技领域跨入国际先进行列，成为继美国、西欧之后又一个获得红外自由电子激光的国家。
为满足高能物理国际合作的要求，高能所于1986年建成了我国第一条国际计算机通讯线路，率先进入国际互联网，为我国信息高速公路的发展做出积极贡献。
1978年至今，高能所共获奖200余项。其中，北京正负电子对撞机工程获国家科技进步特等奖、北京35MeV质子直线加速器工程获国家科技进步一等奖、τ轻子质量的精确测量获国家自然科学二等奖、北京自由电子激光装置获国家科技进步二等奖、ψ（2S）粒子及粲夸克偶素物理的实验研究获国家自然科学二等奖等。近10年来，高能所在国际刊物上发表及被引用的论文数，在全国科研机构中的排序均在前10名之内。
高能所充分发挥多学科综合性研究单位的优势，运用高频、超高真空、微波、精密磁铁制造等多种尖端科学技术开展科技开发工作，主要技术开发领域有加速器技术、核医学仪器、核仪器仪表技术、工业自动化技术、信息技术、精密机械加工等。
2000年7月，国家科技教育领导小组审议通过《关于我国高能物理和先进加速器发展目标的汇报》，认为发展高能物理和先进加速器对提高我国综合科学技术实力、保持我国在该领域的应有地位、稳定一支精干的高能物理研究队伍有着重要意义，并同意在BEPC取得成功的基础上对该装置进行重大改造，用较少的投入继续取得高水平的研究成果。
2001年4月，高能所进入中国科学院知识创新工程二期试点。2003年3月，国家发展改革委员会正式批准了北京正负电子对撞机重大改造工程（BEPCII）项目。高能所面临新的发展机遇和挑战，任重而道远。为确保中国高能物理事业发展目标的实现，高能所的科技人员怀着高度的历史责任感，在知识创新工程的鼓舞下，迅速高效地投入新的战斗。